Der Verein Klassische Yachten Flensburg ist zusammen mit den Vereinen Dampfer Alexandra, dem Förderverein des Schifffahrtsmuseums, dem Museumshafen und dem Förderverein „Gesine“ und „Schlepper Flensburg“ Gesellschafter der Historischen Hafen gGmbH. Ziel dieser gemeinnützigen GmbH ist es, durch Professionalisierung das Ehrenamt von Verwaltungsaufgaben zu entlasten und die Entwicklung der Hafenwestseite zum Historischen Hafen zu fördern. Als Zusammenschluss der Vereine ist die Histosche Hafen gGmbH Ansprechpartner für Politik und Verbände Partner für die Durchführung von Veranstaltungen mit historischem Hintergrund.